2016年5月12日，《云南省教育厅关于申报2016年云南省特色骨干民办高职院校建设项目的通知》（云教民办〔2016〕13号）指出：经过网络评审、项目答辩、专家会评及网络公示，云南工程职业学院通过2016年云南省特色骨干民办高职院校建设项目立项。

大力发展云南特色高等教育，建设有特色的示范高职院校是我省“十三五”教育发展规划的重要内容。通过实施省级特色骨干高职院校建设项目，让高职院校经过三年建设，在办学模式、特色专业建设、人才培养、服务社会和校园文化建设等方面凸显特色和优秀，更好地为我省经济建设和社会发展服务。

学院此次通过云南省特色骨干民办高职院校建设项目立项对加快学院在高等职业教育领域的改革与发展，全面提高人才培养质量和办学水平，发挥高职院校在培养高素质高级技能型专门人才，构建终身教育体系和建设学习型社会等方面起到了重要作用。

2016年5月13日下午，学院教育总监张云钢组织召开了“云南工程职业学院特色骨干院校建设第一次会议”，我院特色骨干院校建设工作正式拉开了序幕。